Проблему у себя решили уже давно, просто отпишусь тут на всякий случай, вдруг кому поможет. Все наши скрипты находились на том же сервере, что и KSC. После их переноса на другой сервер, все заработало как надо. А так не помогали ни настройки, ни патчи, перепробовали наверное все что можно. Техподдержка утверждает, что KSC тут не при чем. Не берусь утверждать, так ли это, т.к. разбираться было честно говоря лень.